Fiumicino possiede poche strutture scolastiche di secondo livello (scuole superiori). Il più grande istituto situato a Fiumicino è il Paolo Baffi, sito nella zona di Isola Sacra in via Lorenzo Bezzi, che offre indirizzo alberghiero, e amministrazione finanza e marketing, ha due succursali, una situata sempre a Isola Sacra in via Giorgio Giorgis, e un'altra a Fregene. Esiste un altro istituto situato a Maccarese, che dista parecchio dal centro abitato di Fiumicino. Gli studenti delle superiori sono quindi spesso costretti a scegliere l'istituto Paolo Baffi o a frequentare istituti di Roma o della vicina Ostia. Nel secondo caso, questo porta a un notevole dispendio di tempo per gli spostamenti, a causa della scarsità dei mezzi pubblici e, nel caso di Ostia, dell'inadeguatezza della rete stradale collegante i due centri.